ドラフト指名順位は、主にフリーエージェントの異動に基づいて変更が加えられます。フリーエージェントは過去2年間の成績によってランクＡ（下の表で名前が赤字の選手）、ランクＢ（同じく青字）、ランクＣの3種類に分けられ、ランクＡの選手を失ったティームはその選手の移籍先の第1巡指名と追加第1巡指名の権利を得ます。また、ランクＢの選手を失ったティームは追加第1巡指名の権利だけを得ます。ただし、前年度の勝率が低い方から数えて15番目までのティームは第1巡指名が保証されるので、そのティームがランクＡの選手を獲得している場合は、第2巡指名の権利を譲渡します。また、ランクＡの選手を複数獲得している場合には同様に第3巡、第4巡と指名権を譲渡します。なお今年度から、ランクＣのフリーエージェントに対する補償は廃止されています。
前年度第1巡指名選手と契約を結べなかったティームは、追加第1巡指名の権利を得ます。今年はアリゾナ・ダイアモンドバックスが、昨年第1巡で指名した投手マックス・シャーザー（下の表の緑字）と契約に合意していないため、第65位指名権を与えられています。しかし、交渉権が消滅する、今年度新人ドラフトの1週間前までに契約に至った場合は、この追加第1位指名の権利は失われます。
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第1巡
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対象選手
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1
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タムパベイ |
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|
2
|
カンザスシティ |
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|
3
|
シカゴ(N) |
|
|
4
|
ピッツバーグ |
|
|
5
|
ボルティモア |
|
|
6
|
ワシントン |
|
|
7
|
ミルウォーキー |
|
|
8
|
コロラド |
|
|
9
|
アリゾナ |
|
|
10
|
サンフランシスコ |
|
|
11
|
シアトル |
|
|
12
|
フロリダ |
|
|
13
|
クリーヴランド |
|
|
14
|
アトランタ |
|
|
15
|
シンシナティ |
|
|
16
|
トロント |
フランク・カタラノット |
|
17
|
テキサス |
カルロス・リー |
|
18
|
セイントルイス |
|
|
19
|
フィラデルフィア |
|
|
20
|
ロサンジェルス(N) |
フリオ・ルゴ |
|
21
|
トロント |
|
|
22
|
サンフランシスコ |
ジェイスン・シュミット |
|
23
|
サンディエゴ |
|
|
24
|
テキサス |
ゲイリー・マシューズ |
|
25
|
シカゴ(A) |
|
|
26
|
オークランド |
|
|
27
|
デトロイト |
|
|
28
|
ミネソタ |
|
|
29
|
サンフランシスコ |
モイセス・アロウ |
|
30
|
ニューヨーク(A) |
|
|
|
追加第1巡
|
対象選手
|
|
31
|
ワシントン |
アルフォンソ・ソリアノ |
|
32
|
サンフランシスコ |
モイセス・アロウ |
|
33
|
アトランタ |
ダニス・バエス |
|
34
|
シンシナティ |
リッチ・オーリリア |
|
35
|
テキサス |
カルロス・リー |
|
36
|
セイントルイス |
ジェフ・スーパン |
|
37
|
フィラデルフィア |
デイヴィッド・デルッチ |
|
38
|
トロント |
ジャスティン・スパイア |
|
39
|
ロサンジェルス(N) |
フリオ・ルゴ |
|
40
|
サンディエゴ |
ウディ・ウィリアムズ |
|
41
|
オークランド |
バリー・ジト |
|
42
|
ニューヨーク(N) |
ロベルト・エルナンデス |
|
43
|
サンフランシスコ |
ジェイスン・シュミット |
|
44
|
テキサス |
ゲイリー・マシューズ |
|
45
|
トロント |
フランク・カタラノット |
|
46
|
サンディエゴ |
デイヴ・ロバーツ |
|
47
|
ニューヨーク(N) |
チャド・ブラッドフォード |
|
48
|
シカゴ(N) |
ホアン・ピア |
|
49
|
ワシントン |
ホセ・ギエン |
|
50
|
アリゾナ |
クレイグ・カウンセル |
|
51
|
サンフランシスコ |
マイク・スタントン |
|
52
|
シアトル |
ギル・メッシュ |
|
53
|
シンシナティ |
スコット・ショーンワイス |
|
54
|
テキサス |
マーク・デロサ |
|
55
|
ボストン |
アレクス・ゴンサレス |
|
56
|
トロント |
テッド・リリー |
|
57
|
サンディエゴ |
パク・チャンホ |
|
58
|
ロサンジェルス(A) |
アダム・ケネディ |
|
59
|
オークランド |
フランク・トーマス |
|
60
|
デトロイト |
ジェイミー・ウォーカー |
|
61
|
アリゾナ |
ミゲル・バティスタ |
|
62
|
ボストン |
キース・フォーク |
|
63
|
サンディエゴ |
アラン・エムブリー |
|
64
|
サンディエゴ |
ライアン・クレスコ |
|
65
|
アリゾナ |
マックス・シャーザー |
|
|
第2巡
|
対象選手
|
|
66
|
タムパベイ |
|
|
67
|
カンザスシティ |
|
|
68
|
ワシントン |
アルフォンソ・ソリアノ |
|
69
|
ピッツバーグ |
|
|
70
|
アトランタ |
ダニス・バエス |
|
71
|
ワシントン |
|
|
72
|
セイントルイス |
ジェフ・スーパン |
|
73
|
コロラド |
|
|
74
|
アリゾナ |
|
|
75
|
オークランド |
バリー・ジト |
|
76
|
シアトル |
|
|
77
|
フロリダ |
|
|
78
|
ニューヨーク(N) |
ロベルト・エルナンデス |
|
79
|
アトランタ |
|
|
80
|
シンシナティ |
|
|
81
|
テキサス |
|
|
82
|
サンディエゴ |
ウディ・ウィリアムズ |
|
83
|
セイントルイス |
|
|
84
|
フィラデルフィア |
|
|
85
|
ボストン |
|
|
86
|
トロント |
|
|
87
|
ロサンジェルス(N) |
|
|
88
|
サンディエゴ |
|
|
89
|
トロント |
ジャスティン・スパイア |
|
90
|
シカゴ(A) |
|
|
91
|
オークランド |
|
|
92
|
デトロイト |
|
|
93
|
ミネソタ |
|
|
94
|
ニューヨーク(N) |
|
|
95
|
ニューヨーク(A) |
|
|
|
第3巡
|
対象選手
|
|
96
|
タムパベイ |
|
|
97
|
カンザスシティ |
|
|
98
|
シカゴ(N) |
|
|
99
|
ピッツバーグ |
|
|
100
|
ニューヨーク(N) |
チャド・ブラッドフォード |
|
101
|
ワシントン |
|
|
102
|
ミルウォーキー |
|
|
103
|
コロラド |
|
|
104
|
アリゾナ |
|
|
105
|
シンシナティ |
リッチ・オーリリア |
|
106
|
シアトル |
|
|
107
|
フロリダ |
|
|
108
|
フィラデルフィア |
デイヴィッド・デルッチ |
|
109
|
アトランタ |
|
|
110
|
シンシナティ |
|
|
111
|
テキサス |
|
|
112
|
ヒューストン |
|
|
113
|
セイントルイス |
|
|
114
|
フィラデルフィア |
|
|
115
|
ボストン |
|
|
116
|
トロント |
|
|
117
|
ロサンジェルス(N) |
|
|
118
|
サンディエゴ |
|
|
119
|
ロサンジェルス(A) |
|
|
120
|
シカゴ(A) |
|
|
121
|
オークランド |
|
|
122
|
デトロイト |
|
|
123
|
ミネソタ |
|
|
124
|
ニューヨーク(N) |
|
|
125
|
ニューヨーク(A) |
|
|
|
第4巡
|
対象選手
|
|
126
|
タムパベイ |
|
|
127
|
カンザスシティ |
|
|
128
|
シカゴ(N) |
|
|
129
|
ピッツバーグ |
|
|
130
|
ボルティモア |
|
|
131
|
ワシントン |
|
|
132
|
ミルウォーキー |
|
|
133
|
コロラド |
|
|
134
|
アリゾナ |
|
|
135
|
サンディエゴ |
デイヴ・ロバーツ |
|
136
|
シアトル |
|
|
137
|
フロリダ |
|
|
138
|
クリーヴランド |
|
|
139
|
アトランタ |
|
|
140
|
シンシナティ |
|
|
141
|
テキサス |
|
|
142
|
ヒューストン |
|
|
143
|
セイントルイス |
|
|
144
|
フィラデルフィア |
|
|
145
|
ボストン |
|
|
146
|
トロント |
|
|
147
|
ロサンジェルス(N) |
|
|
148
|
サンディエゴ |
|
|
149
|
ロサンジェルス(A) |
|
|
150
|
シカゴ(A) |
|
|
151
|
オークランド |
|
|
152
|
デトロイト |
|
|
153
|
ミネソタ |
|
|
154
|
ニューヨーク(N) |
|
|
155
|
ニューヨーク(A) |
|
|
|
第5巡
|
対象選手
|
|
156
|
タムパベイ |
|
|
157
|
カンザスシティ |
|
|
158
|
シカゴ(N) |
|
|
159
|
ピッツバーグ |
|
|
160
|
ボルティモア |
|
|
161
|
ワシントン |
|
|
162
|
ミルウォーキー |
|
|
163
|
コロラド |
|
|
164
|
アリゾナ |
|
|
165
|
サンフランシスコ |
|
|
166
|
シアトル |
|
|
167
|
フロリダ |
|
|
168
|
クリーヴランド |
|
|
169
|
アトランタ |
|
|
170
|
シンシナティ |
|
|
171
|
テキサス |
|
|
172
|
ヒューストン |
|
|
173
|
セイントルイス |
|
|
174
|
フィラデルフィア |
|
|
175
|
ボストン |
|
|
176
|
トロント |
|
|
177
|
ロサンジェルス(N) |
|
|
178
|
サンディエゴ |
|
|
179
|
ロサンジェルス(A) |
|
|
180
|
シカゴ(A) |
|
|
181
|
オークランド |
|
|
182
|
デトロイト |
|
|
183
|
ミネソタ |
|
|
184
|
ニューヨーク(N) |
|
|
185
|
ニューヨーク(A) |
|